Охрана
Дарвинский заповедник сохраняет основные нерестилища и места нагула всего промыслового стада рыб Рыбинского водохранилища. 10% акватории водохранилища, расположенные в заповеднике, обеспечивают воспроизводство рыб всего водоема, обеспечивая тем самым промысловое и любительское рыболовство.
Наблюдающийся в последние годы рост популярности Рыбинского водохранилища, как водоема с хорошими условиями для любительского рыболовства, сопровождается усилением рекреационной нагрузки. Это приводит к усилению пресса браконьерства на территорию заповедника. В связи с этим инспекция по охране заповедной территории постоянно работает в напряженном режиме.
Для улучшения сохранения природного комплекса заповедника в 2000-2002 годах в двух субъектах Федерации вокруг него была создана охранная зона, полностью окружившая заповедное ядро. Это дало возможность заповеднику в 2002 году получить статус международного биосферного резервата ЮНЕСКО.
В целях обеспечения действенной охраны заповедника полностью пересмотрена концепция охраны. В настоящее время охрана территории производится мобильными оперативными группами, которые возглавляют старшие инспектора. Существенное внимание уделяется кадровым вопросам, при формировании штата охраны предпочтение отдается бывшим сотрудникам милиции, имеющим опыт оперативной работы юридическое образование.
В заповеднике 3 лесничества. По лесничествам созданы оперативные группы. Согласно графику работы ведутся мероприятия, направленные на охрану территории ООПТ.
В результате работы оперативных групп составляются административные протоколы и выявляются нарушения Закона об ООПТ.
В распоряжении оперативных групп имеются современные транспортные средства (современные быстроходные катера, судно на воздушной подушке, быстроходные снегоходы). Сотрудники оперативных групп в первоочередном порядке обеспечиваются ГСМ, форменным обмундированием, спецодеждой.